Суд снял льготы с резидента «Сколково»: что это значит для всех участников проекта

14 августа 2026 Арбитражный суд Московского округа вынес Постановление по делу, на которое стоит обратить внимание всем резидентам «Сколково», чьи предприятия входят в группы компаний. Суд кассационной инстанции фактически снял налоговые льготы с резидента «Сколково» по мотиву дробления бизнеса — и сейчас это может приобрести тенденциозный характер.

Фабула спора: группа компаний по итогам выездной проверки получила доначисления порядка 185 млн ₽ налогов, около 90 млн ₽ пеней и более 12 млн ₽ штрафа. В состав группы входила, в том числе и компания — резидент «Сколково» с освобождением от уплаты НДС и налога на прибыль и пониженным размером страховых взносов. Апелляционная инстанция резидента Сколково вывела из-под дробления, указав на самостоятельную деловую цель — собственная инновационная разработка, ради которой получен статус, и обособление рисков от основной компании. Однако кассационная инстанция эти выводы не подтвердила.

Четыре актуальных тезиса из этой истории

• Общая система ≠ равные условия. Формальная принадлежность основной компании и резидента Сколково к общей системе налогообложения не означает одинаковую налоговую нагрузку: у резидента Сколково реальная налоговая экономия (выгода) за счёт льгот.
• Льгота исвоя разработка — неиндульгенция. Статус «Сколково» и наличие собственной разработки сами по себе не опровергают факт интеграции резидента в группу компаний, если ИФНС доказала совокупность признаков, характерных для дробления.
• Цель создания ≠ правомерность распределения выручки. Деловая цель при создании компании не оправдывает последующего перевода на неё выручки от клиентов, если доказан единый производственный процесс.
• Статья 54.1 НК применяется, в том числе ипротив резидента Сколково. К резиденту применяется статья 54.1 НК, если через резидента искусственно ведется часть единого хозяйственного процесса группы и перераспределяется выручки.

Главная формула суда: неправомерность не в самих льготах, а в искусственном распределении выручки в пользу освобождённого гот уплаты налогов лица без реального обособления деятельности. Раньше этот статус давал ощущение неприкосновенности, а теперь наличие налоговых льгот в связи с ним может стать для проверяющих пристальной мишенью.

20 признаков дробления бизнеса на основе данных ФНС и судебной практики

Что делать резиденту

Протестировать себя по признакам дробления и честно ответить: есть ли полная организационная, функциональная и финансовая обособленность компании в Сколково от остальных компаний группы, если ли элементы подчиненности и самостоятельно ли она генерит выручку.

Велика вероятность, что аналогичный подход будет транслирован на пользователей иных налоговых преференций — на участников ОЭЗ, ТОР и других проектов.

Консультанты АКГ «Капитал» помогают найти баланс между величиной налоговой нагрузки и налоговыми рисками.